系统生物学研究：系统生物学可同时整合基因体学、蛋白质体学及生物信息学等研究，以系统性的方法分析生物体或细胞中各种基因和功能性蛋白质间复杂的交互关系，并了解这些关系是如何运作。 

酵素催化有机合成： a.用酵素催化合成光学活性胺基酸、蛋白质及医药中间体。 b.高稳定性酵素之筛选及新酵素合成法之开发。 

以化学法研究蛋白质工程：利用计算机模拟及化学合成进行蛋白质工程研究 a.以组合研究法研究酵素之特异选择性。 b.研究与设计酵素之抑制剂。 c.开发新糖蛋白合成方法。 d.蛋白质受体分离及三度空间结构决定。